多数肾囊肿无须治疗，需根据囊肿大小、症状及并发症决定处理方式，主要观察指标有囊肿直径增长情况、是否伴随血尿或高血压等。
1、观察随访直径小于4厘米且无症状的单纯性肾囊肿通常只需定期复查超声，每6-12个月监测囊肿变化。
2、穿刺硬化大于5厘米的囊肿若引起腰部胀痛，可在超声引导下穿刺抽液并注射硬化剂，复发率约15-30％。
3、腹腔镜手术反复感染或压迫肾实质的囊肿需行腹腔镜去顶减压术，手术创伤小且能保留肾功能。
4、病因治疗多囊肾等遗传性疾病需控制血压和感染，晚期可能需透析或肾移植。
日常应避免剧烈运动导致囊肿破裂，每年体检监测肾功能，出现腰痛加剧或血尿需及时就诊。
