肛瘘多数情况下建议手术治疗，但存在局部急性感染、合并严重基础疾病、高位复杂性肛瘘未充分评估或患者全身状况无法耐受手术时暂不建议手术。
1. 急性感染期肛周脓肿未控制或瘘管急性化脓时手术可能扩散感染，需先进行抗生素治疗如头孢克肟、甲硝唑联合局部高锰酸钾坐浴，待炎症消退后再评估手术时机。
2. 基础疾病未控合并未控制的糖尿病、凝血功能障碍或免疫缺陷疾病时手术风险高，需先调控血糖至8mmol/L以下，纠正凝血指标，必要时输注血小板或新鲜冰冻血浆。
3. 高位复杂瘘管涉及超过30％肛管直肠环的高位瘘需MRI明确走行，盲目手术可能导致肛门失禁，建议采用挂线疗法分阶段处理或生物蛋白胶封堵等保守措施过渡。
4. 全身状态差心肺功能不全、恶病质等患者可先选择肛瘘栓填塞等微创处理，配合康复新液促进创面愈合，待营养状态改善后再考虑确定性手术。
日常需保持会阴清洁干燥，避免久坐压迫，便后可用皮肤保护膜隔离创面，高蛋白饮食促进组织修复，定期复查瘘管变化情况。
