秦皮具有清热燥湿、收涩止痢、明目退翳等功效，主要用于湿热泻痢、目赤肿痛、带下阴痒等症状的治疗。
秦皮苦寒降泄，能清除肠道湿热，适用于湿热下注引起的腹泻、痢疾，常与黄连、黄柏等配伍使用。
所含秦皮素等成分可抑制肠道蠕动，对久痢不止、赤白痢疾有收敛固涩作用，临床多与石榴皮同用。
煎汤外洗可缓解肝火上炎导致的目赤肿痛，其有效成分能减轻结膜充血，传统方剂常配伍菊花、决明子。
体外试验显示对痢疾杆菌、金黄色葡萄球菌等有抑制作用，现代多用于急性肠炎、细菌性痢疾等感染性疾病。
使用秦皮需辨证施治，脾胃虚寒者慎用，建议在中医师指导下配伍应用，服药期间忌食生冷油腻食物。
