马齿苋具有清热解毒、凉血止血、利湿消肿等功效，主要用于治疗热毒血痢、痈肿疔疮、湿疹丹毒等疾病。
马齿苋性寒味酸，能有效清除体内热毒，适用于热毒引起的皮肤红肿、咽喉肿痛等症状，可配伍金银花、蒲公英等药材增强疗效。
对血热妄行导致的便血、痔疮出血有收敛止血作用，常与地榆、槐花同用，其鲜品捣敷可缓解外伤出血。
通过促进水液代谢改善湿热下注引起的水肿、白带异常，临床多与车前草、茯苓配伍治疗泌尿系统感染。
含有的生物碱和黄酮类物质对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌等具有抑制作用，可外敷治疗皮肤化脓性感染。
新鲜马齿苋可凉拌或煮粥，脾胃虚寒者慎用；药用需遵医嘱配伍相应中成药如马齿苋颗粒、复方马齿苋片等。
