肝素主要用于抗凝血治疗，其作用包括预防血栓形成、治疗深静脉血栓、辅助血液透析及心脏手术中的抗凝。肝素通过抑制凝血酶活性发挥抗凝作用。
肝素可阻断凝血因子活化，抑制纤维蛋白形成，有效预防术后或长期卧床患者的静脉血栓栓塞症。临床常用普通肝素、低分子肝素钠、依诺肝素等。
对已形成的深静脉血栓或肺栓塞，肝素能阻止血栓扩大，为后续溶栓治疗争取时间。需监测活化部分凝血活酶时间调整剂量。
血液透析时使用肝素可防止体外循环管路凝血，维持透析效率。常用枸橼酸钠抗凝替代方案适用于出血高风险患者。
体外循环中需大剂量肝素维持血液流动性，术后用鱼精蛋白中和。新型直接口服抗凝药不能替代术中肝素使用。
使用肝素期间须定期监测凝血功能，避免外伤碰撞，出现牙龈出血或皮下淤青应及时就医调整用药方案。
