遗传代谢病与闭经的关系可能由基因缺陷导致激素合成障碍、代谢产物蓄积干扰卵巢功能、垂体-下丘脑轴受累、罕见酶缺乏引发内分泌紊乱等原因引起。遗传代谢病可通过基因检测、激素替代治疗、代谢干预、多学科联合管理等方式改善。
部分遗传代谢病如先天性肾上腺皮质增生症，因酶缺陷导致雄激素过量合成，抑制卵巢功能，表现为闭经。治疗需使用糖皮质激素替代（如氢化可的松，并监测电解质平衡。
糖原贮积病、黏多糖贮积症等疾病中异常代谢物沉积在卵巢组织，可能导致卵泡发育停滞。需通过饮食控制（如生玉米淀粉和酶替代治疗（如阿葡糖苷酶α缓解症状。
某些氨基酸代谢异常（如苯丙酮尿症未控制时，毒性物质可损伤下丘脑神经元，导致促性腺激素释放不足。需限制苯丙氨酸摄入并补充特制配方奶粉。
极少数病例如17α-羟化酶缺乏症，直接影响雌激素合成通路，需终身使用雌孕激素联合制剂（如戊酸雌二醇+地屈孕酮维持月经周期。
建议存在不明原因闭经者完善血尿代谢筛查，确诊后需在遗传代谢科与妇科共同指导下制定个体化治疗方案，同时注意钙质与维生素D补充预防骨质疏松。
