非淋菌性尿道炎可能引起尿道狭窄、前列腺炎、附睾炎、不孕不育等危害，需及时干预防止并发症。
长期炎症刺激导致尿道黏膜纤维化，可能引发排尿困难。需通过尿道扩张术或药物灌注治疗，常用药物包括头孢曲松、多西环素、阿奇霉素。
病原体逆行感染引发会阴胀痛和尿频。可能与沙眼衣原体感染有关，表现为发热和排尿灼痛。可选用左氧氟沙星、米诺环素、克拉霉素等抗生素。
细菌经输精管扩散导致阴囊肿胀疼痛。通常与解脲支原体感染相关，伴随高热和坠胀感。治疗需应用莫西沙星、四环素、罗红霉素等药物。
慢性炎症造成生殖道粘连阻塞，影响精子输送。女性可能并发盆腔炎和输卵管堵塞。建议夫妻同治，使用敏感抗生素如司帕沙星、交沙霉素、美满霉素。
治疗期间应避免性生活，保持会阴清洁，多饮水促进排尿冲洗尿道，定期复查确保病原体清除。
