宫颈囊肿多数属于生理性改变，通常无须药物治疗。若合并感染或症状明显，可遵医嘱使用抗生素如头孢克肟、阿奇霉素、甲硝唑等，或中成药如妇科千金片、金刚藤胶囊等辅助治疗。
细菌感染引起的宫颈囊肿可选用头孢克肟等广谱抗生素，伴有盆腔炎时需联用甲硝唑抗厌氧菌。
妇科千金片适用于慢性炎症引起的下腹坠痛，金刚藤胶囊对湿热瘀阻型囊肿有辅助消散作用。
合并宫颈炎时可使用保妇康栓等阴道栓剂，需配合医生进行宫颈分泌物检查后选择针对性药物。
较大囊肿或反复发作者可采用激光、微波等物理治疗，需在妇科门诊评估后实施。
日常保持会阴清洁，避免频繁阴道冲洗，急性期禁止性生活，定期进行宫颈癌筛查。
