高位复杂性肛瘘可能导致肛周脓肿反复发作、肛门失禁、局部组织坏死及全身感染，需及时就医处理。
瘘管长期存在会形成感染灶，导致肛周脓肿反复化脓破溃。急性期需切开引流，慢性期建议行肛瘘切除术。
瘘管侵蚀肛门括约肌可能造成控便能力下降。轻度可通过提肛训练改善，重度需括约肌修复手术。
长期炎症刺激会导致瘘管周围组织纤维化坏死。需手术清除坏死组织并行挂线疗法促进愈合。
细菌经瘘管入血可能引发败血症。需静脉注射抗生素控制感染，必要时行脓腔引流。
患者应保持肛门清洁干燥，避免久坐久站，饮食注意补充优质蛋白和维生素促进创面愈合。
