脑炎后遗症主要包括认知功能障碍、运动障碍、癫痫发作、精神行为异常等，严重程度与脑损伤范围及治疗时机密切相关。
脑炎可能损伤大脑皮层及海马体，导致记忆力减退、注意力不集中或执行功能下降，早期康复训练有助于改善症状。
基底节或小脑受累时可出现肢体瘫痪、共济失调，物理治疗结合巴氯芬、左旋多巴等药物可缓解肌张力异常。
颞叶或额叶病灶易引发继发性癫痫，需长期服用丙戊酸钠、左乙拉西坦等抗癫痫药物控制发作。
边缘系统损伤可能导致情绪失控或人格改变，奥氮平、舍曲林等药物配合心理干预可稳定精神状态。
脑炎患者应定期复查脑电图与影像学检查，保持规律作息并避免过度疲劳，康复期可适当补充核桃、深海鱼等富含欧米伽3脂肪酸的食物。
