挑选公木瓜主要观察外形、触感、气味等特征。公木瓜通常指未授粉的雄性木瓜树果实，外形较细长、表皮光滑、重量较轻，果肉较少且籽粒稀疏。
公木瓜外形多呈长圆柱形或纺锤形，两端较尖，横截面接近椭圆形。成熟时表皮呈均匀青黄色，表面光滑无凹陷或凸起，果蒂端无膨大现象。用手轻按果身时能感受到弹性适中的硬度，既不会过硬也不会过软。切开后果肉颜色偏浅黄或淡橙色，肉质较紧实，籽粒集中在中央且数量明显少于母木瓜。未成熟的公木瓜带有青草味，成熟后散发清淡甜香，但甜度通常低于母木瓜。挑选时可优先选择无明显擦伤、霉斑或虫蛀的果实，存放时建议置于阴凉通风处，避免与乙烯释放量高的水果混放加速腐烂。
木瓜富含木瓜蛋白酶和维生素C，适合制作沙拉或炖汤。食用前建议削皮去籽，胃肠功能较弱者应控制摄入量。若需催熟可将木瓜与苹果或香蕉密封存放，表皮出现黄斑时口感最佳。购买后2-3天内食用完毕，避免营养流失。
