HPV病毒可通过物理治疗、药物治疗、免疫调节、手术切除等方式清除，具体方式需根据病毒亚型与感染部位决定。
冷冻疗法或激光治疗可去除体表疣体，适用于低危型HPV引发的皮肤黏膜病变，治疗后需保持创面清洁干燥。
咪喹莫特乳膏、三氯乙酸溶液等局部用药能促进疣体脱落，干扰素凝胶有助于抑制病毒复制，均需严格遵医嘱使用。
口服匹多莫德或注射干扰素可增强细胞免疫，适用于持续感染或反复发作病例，需配合定期复查HPV分型检测。
高频电刀或冷刀锥切适用于高危型HPV导致的宫颈高级别病变，术后需进行病理检查确认边缘是否清除干净。
建议感染者接种HPV疫苗预防其他亚型感染，保持规律作息提升免疫力，避免吸烟饮酒等降低免疫力的行为。
