长期大量饮用银杏叶茶可能导致血小板减少、胃肠道不适、肝功能损害及过敏反应，银杏叶制剂与部分药物存在相互作用风险。
银杏叶中的黄酮苷类成分可能抑制血小板聚集，长期过量饮用会延长凝血时间，出现牙龈出血、皮下瘀斑等症状，需定期监测血常规。
银杏酸等成分直接刺激胃肠黏膜，可能引发恶心呕吐、腹痛腹泻，胃肠溃疡患者应避免空腹饮用，可选择饭后少量服用。
银杏内酯代谢产物可能损伤肝细胞，表现为转氨酶升高和黄疸，肝功能异常者禁用，服用期间须定期检查肝功能指标。
银杏蛋白可诱发荨麻疹或过敏性休克，有花粉过敏史者更易发生，初次饮用应观察是否出现皮肤瘙痒、呼吸困难等过敏症状。
饮用银杏叶茶每日不宜超过3克，连续服用不超过3个月，服用抗凝药、抗癫痫药等需间隔2小时，孕妇及手术前后两周禁用。
