鱼腥草对缓解扁桃体发炎可能有一定辅助效果，但无法替代规范治疗。扁桃体发炎多由细菌或病毒感染引起，需根据病因选择抗生素或抗病毒药物。
鱼腥草含有癸酰乙醛等成分，具有抑菌、抗炎作用，可能减轻扁桃体红肿疼痛。鲜品捣汁含漱或干品煎汤代茶饮，有助于缓解咽部不适。但鱼腥草对链球菌等常见致病菌的抑制作用有限，且可能引起过敏反应，表现为皮肤瘙痒、恶心等症状。
细菌性扁桃体炎需使用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克洛颗粒等抗生素；病毒性感染可配合蓝芩口服液、开喉剑喷雾剂等中成药。若出现化脓、持续高热或呼吸困难，提示可能存在扁桃体周围脓肿等并发症，须立即就医。
治疗期间应避免辛辣刺激食物，保持口腔清洁，用淡盐水漱口。急性期需卧床休息，每日饮水1500-2000毫升。反复发作的慢性扁桃体炎患者，可考虑在炎症控制后评估手术切除指征。使用鱼腥草前建议咨询中医师，过敏体质者慎用。
