肺炎衣原体感染通常好治疗，多数患者通过规范用药可痊愈，但免疫功能低下者可能出现病情迁延。
肺炎衣原体感染属于非典型肺炎常见病原体，对四环素类、大环内酯类抗生素敏感。临床常用多西环素片、阿奇霉素分散片、克拉霉素缓释片等药物，治疗周期一般为14-21天。早期规范治疗可有效缓解发热、干咳、咽痛等症状，胸部影像学表现多在1-2周内改善。门诊患者口服药物即可控制病情，治疗期间需注意休息并保持充足水分摄入。
部分合并基础疾病患者或免疫功能缺陷者可能出现治疗反应延迟，需根据药敏结果调整抗生素方案。极少数重症病例可能发展为呼吸窘迫，需住院接受静脉给药治疗。新生儿感染可能引发结膜炎或中耳炎等并发症，孕妇感染需避免使用四环素类药物。耐药菌株感染虽罕见，但可能延长治疗周期至4周以上。
确诊后应严格遵医嘱完成全程抗生素治疗，避免自行停药导致复发。恢复期应保持室内空气流通，避免接触烟雾刺激。若用药3天后症状无缓解或出现胸痛、呼吸困难，需及时复诊调整方案。日常注意手卫生与呼吸道防护，免疫力低下者可考虑接种肺炎疫苗预防混合感染。
