肠系膜血管堵塞的治疗难度与病情严重程度有关，早期发现并干预通常预后较好，但延误治疗可能导致肠坏死等严重并发症。肠系膜血管堵塞主要由动脉栓塞、血栓形成或低血流状态引起，需根据病因采取抗凝、溶栓或手术等治疗。
肠系膜血管堵塞若处于早期阶段，血管尚未完全闭塞且未出现肠管缺血坏死，通过及时抗凝治疗如使用低分子肝素钙注射液、注射用尿激酶等药物，或血管介入手术恢复血流，多数患者症状可缓解。此时胃肠功能可能逐渐恢复，后续需长期服用华法林钠片等抗凝药物预防复发，并控制高血压、高血脂等基础疾病。
若血管堵塞时间较长已导致肠壁缺血坏死，需紧急行肠切除吻合术或肠造瘘术，术后可能遗留消化吸收功能障碍，需长期营养支持。合并感染性休克或多器官功能衰竭时，死亡率显著升高。高龄、合并心血管疾病或就诊延迟的患者预后更差，部分需终身依赖肠外营养。
肠系膜血管堵塞患者治疗后需定期复查凝血功能及血管影像学检查，严格低脂饮食，避免脱水或剧烈呕吐诱发血流灌注不足。出现持续腹痛、便血等症状需立即就医，日常可适度活动促进血液循环，但避免突然体位变化导致血管痉挛。
