艾滋病患者出现腹泻可能由免疫缺陷继发感染、肠道机会性病原体侵袭、抗病毒药物副作用、胃肠功能紊乱等原因引起，治疗需针对病因采取抗感染治疗、调整用药方案、补充电解质及营养支持等措施。
1、抗感染治疗艾滋病患者免疫力低下易合并隐孢子虫、巨细胞病毒等感染，表现为水样便伴腹痛。确诊后可使用硝唑尼特治疗隐孢子虫，更昔洛韦对抗巨细胞病毒，同时配合蒙脱石散保护肠黏膜。
2、调整用药方案部分抗逆转录病毒药物如洛匹那韦可能引发药物性腹泻。医生可能更换为腹泻发生率较低的度鲁特韦，或联用洛哌丁胺缓解症状，需严格监测病毒载量变化。
3、电解质补充持续腹泻易导致脱水及低钾血症，需口服补液盐维持水电解质平衡，重度脱水者需静脉输注氯化钠注射液，同时监测血压及尿量。
4、营养支持慢性腹泻患者易出现营养不良，建议采用低脂低渣饮食，分次补充短肽型肠内营养粉，必要时静脉输注复方氨基酸注射液维持氮平衡。
艾滋病相关性腹泻需定期检测CD4细胞计数评估免疫状态，避免进食生冷食物，注意餐具消毒。若腹泻持续超过3天或出现血便应立即就医。
