鼻窦炎手术后存在复发可能，但规范治疗可显著降低复发概率并实现临床治愈。鼻窦炎手术后的复发与根治效果主要取决于病因控制、手术方式选择及术后护理质量。
慢性鼻窦炎患者接受功能性内镜鼻窦手术后，五年复发率通常控制在较低水平。手术通过开放阻塞的鼻窦自然开口、清除不可逆病变黏膜，能有效恢复鼻腔通气引流功能。术后配合规范药物治疗如鼻用糖皮质激素喷剂、黏液促排剂及短期抗生素，可消除残余炎症。患者需严格遵循术后鼻腔冲洗、定期复诊等要求，避免接触过敏原或感染源。多数患者经系统治疗后症状完全消失且无影像学异常，可达到临床治愈标准。
解剖结构异常未彻底矫正、过敏性鼻炎未控制或术后护理不当可能导致复发。嗜酸性粒细胞型慢性鼻窦炎因存在Th2型免疫反应，复发风险相对较高。部分患者合并哮喘、阿司匹林不耐受等全身性疾病时，需长期药物维持治疗。真菌性鼻窦炎或合并鼻息肉者，术后需加强抗真菌治疗或生物制剂干预。极少数患者因瘢痕体质导致窦口再狭窄，需二次手术处理。
术后应保持低糖饮食减少黏膜水肿，每日用生理盐水鼻腔冲洗至少三个月。避免用力擤鼻、潜水或乘坐飞机等可能引起气压伤的行为。出现脓涕、头痛等症状加重时需及时复查鼻内镜。合并过敏体质者需持续使用抗组胺药，冬季注意佩戴口罩预防呼吸道感染。建议术后第一年每三个月复查一次鼻窦CT，根据黏膜恢复情况逐步调整用药方案。
