先天性心脏病不一定会遗传，多数情况下与遗传因素无关，少数情况可能与遗传综合征或家族病史有关。先天性心脏病通常是胚胎发育异常所致，环境因素、孕期感染或药物暴露等非遗传原因更常见。
大多数先天性心脏病属于散发病例，父母无心脏病史时后代患病概率较低。胚胎发育过程中若心脏结构形成受阻，可能因孕妇接触辐射、病毒感染、糖尿病控制不佳或服用致畸药物导致。这类情况通常不涉及基因异常，后代再发风险与普通人群相近。
部分先天性心脏病与遗传缺陷相关，如马凡综合征、努南综合征等单基因遗传病常合并心脏畸形。父母一方患特定类型先心病时，子女遗传概率可能升高。染色体异常如21三体综合征患儿中，约半数合并房室间隔缺损等心脏问题。此类情况需通过基因检测评估家族遗传风险。
建议有先心病家族史的夫妇孕前进行遗传咨询，孕期做好超声心动图筛查。新生儿出现喂养困难、呼吸急促等症状时应及时就医。日常需避免接触烟草、酒精等致畸物，合理补充叶酸有助于降低胎儿心脏发育异常风险。
