吃小龙虾一般不能与富含维生素C的食物、高鞣酸食物、高嘌呤食物、寒性食物以及酒精类饮品同食。小龙虾含有五价砷化合物，与维生素C结合可能产生有害物质；鞣酸会影响蛋白质吸收；高嘌呤组合可能加重尿酸代谢负担；寒性食物可能引发胃肠不适；酒精可能增加过敏风险或加重肝脏负担。
小龙虾与富含维生素C的柑橘类水果、猕猴桃等同时食用时，虾体内的五价砷可能在维生素C作用下转化为三价砷。虽然日常食用量通常不会达到中毒剂量，但长期大量搭配可能增加健康风险。小龙虾富含优质蛋白，与柿子、浓茶等高鞣酸食物同食会形成不易消化的沉淀物，导致腹痛腹胀。小龙虾本身嘌呤含量较高，若与动物内脏、啤酒等高嘌呤食物搭配，可能诱发痛风发作。从中医角度，小龙虾属寒性食材，与西瓜、苦瓜等寒凉食物同食易引起腹泻。酒精会加速虾蛋白分解产生组胺，对于过敏体质者可能诱发皮肤瘙痒、红肿等反应。
小龙虾头部易蓄积重金属，建议食用前去除头部和虾线。过敏体质人群首次食用应少量尝试，观察有无皮疹、呼吸困难等过敏反应。死虾会产生组胺毒素，须确保烹饪前小龙虾鲜活。食用后出现恶心呕吐等症状应及时就医。不建议孕妇、痛风患者、肾功能不全者大量食用小龙虾，儿童应在家长监护下剥壳食用避免噎呛。
