肛瘘通常需要手术治疗才能彻底治愈，非手术方法可能暂时缓解症状但难以根治。肛瘘是肛周脓肿破溃后形成的异常管道，主要治疗方法有肛瘘切除术、肛瘘挂线术等手术方式，保守治疗如抗生素、坐浴等仅适用于暂时控制感染或术前准备。
对于单纯性低位肛瘘，部分患者可能通过长期抗生素治疗和局部护理使症状减轻，但复发概率较高。抗生素如头孢克肟分散片、甲硝唑片等可控制急性感染，配合高锰酸钾坐浴能缓解红肿疼痛。这类治疗无法消除瘘管内壁的上皮化组织，病灶持续存在可能导致反复流脓、疼痛甚至继发复杂性肛瘘。
复杂性肛瘘或高位肛瘘必须手术干预，保守治疗基本无效。这类肛瘘常穿透多个括约肌层，自行愈合概率极低。拖延手术可能造成肛门失禁、直肠阴道瘘等严重并发症。术前通过磁共振或超声检查明确瘘管走向，采用保留括约肌的肛瘘切开术或生物蛋白胶封堵术可降低复发风险。
术后需保持肛门清洁干燥，每日用康复新液清洗创面，排便后及时用碘伏消毒。饮食避免辛辣刺激食物，增加燕麦、火龙果等富含膳食纤维的摄入。术后1个月内避免久坐和剧烈运动，定期复查确认瘘管愈合情况。若出现发热、创面渗液增多等症状需立即就医。
