慢性扁桃体炎治疗的预后通常较好，多数患者通过规范治疗可有效控制症状并减少复发。预后差异主要与治疗依从性、是否合并并发症及个体免疫状态有关。
慢性扁桃体炎经规范药物治疗后，症状缓解率较高。急性发作期可遵医嘱使用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢呋辛酯片等抗生素控制感染，辅以复方氯己定含漱液减轻局部炎症。日常需避免辛辣刺激饮食，保持口腔卫生，规律作息以增强免疫力。若反复发作或合并睡眠呼吸暂停、扁桃体周围脓肿等并发症，需考虑扁桃体切除术，术后恢复期约1-2周，多数患者术后症状显著改善。
少数患者可能因耐药菌感染、治疗不彻底或免疫缺陷导致预后不佳，表现为症状迁延或频繁复发。此类情况需进一步排查糖尿病、艾滋病等基础疾病，必要时调整抗生素方案或联合免疫调节治疗。儿童患者若因腺样体肥大影响呼吸，可能需同步切除腺样体以优化远期效果。
慢性扁桃体炎患者应定期复查喉镜，监测扁桃体状态。术后患者需注意避免剧烈运动及硬质食物，预防创面出血。长期吸烟、接触粉尘者应改善环境因素，降低复发风险。若出现持续发热、吞咽困难或颈部淋巴结肿大，需及时就医排除其他疾病。
