先天性心脏病可能有后遗症，具体与心脏畸形类型、手术干预时机及术后管理有关。常见后遗症包括心律失常、心功能不全、肺动脉高压等，部分患者需长期随访和药物治疗。
先天性心脏病术后可能遗留心律失常，尤其是复杂畸形矫正术后。心脏传导系统在手术中可能受到损伤，导致窦房结功能异常或房室传导阻滞。患者可能出现心悸、乏力等症状，需通过动态心电图监测评估，必要时安装起搏器。心功能不全是另一常见后遗症，由于心脏结构异常导致心肌代偿性肥厚或扩张，影响收缩舒张功能。这类患者需限制钠盐摄入，遵医嘱使用地高辛片、呋塞米片等药物支持心功能。
部分先天性心脏病患者术后可能发展为肺动脉高压，特别是左向右分流型先心病未及时治疗者。肺血管阻力持续升高会导致右心负荷加重，表现为活动后气促、咯血等症状。这类情况需使用波生坦片、他达拉非片等靶向药物控制病情进展。少数法洛四联症患者术后可能残留右心室流出道梗阻，需通过心脏超声定期评估，必要时行二次手术矫正。
建议先天性心脏病患者术后定期复查心脏超声、胸片及运动负荷试验，保持低盐低脂饮食，避免剧烈运动。出现胸闷、下肢水肿等症状时应及时就诊，由心内科医生调整治疗方案。规范的终身随访能有效降低后遗症对生活质量的影响。
