对于孕妇和准备怀孕的女性来说，电脑断层扫描应该非常谨慎和小心，因为电脑断层扫描使用x光并且有辐射，这可能对胎儿的生长发育有一定的影响。当然，可能性很低，但也应该小心谨慎。孕妇如果想做骨盆和下腹部的电脑断层扫描，应该更加小心。孕妇不是完全不能做电脑断层扫描，也要分情况。
正常情况下，怀孕后不需要进行电脑断层扫描。电脑断层扫描容易导致胚胎畸形，尤其是腰腹部电脑断层扫描或骨盆电脑断层扫描，在妊娠期间更容易导致胚胎畸形。如果在此期间进行电脑断层扫描，通常不需要保留胚胎，人工流产或药物流产的对症治疗可在医院进行。
