酒精能穿透人体皮肤进入人体，但渗透量通常极少且速度缓慢。医用酒精主要作用于皮肤表面，完整皮肤对酒精的屏障作用显著。
酒精作为小分子物质确实可通过皮肤角质层被动扩散，但健康皮肤的表皮屏障能有效阻挡大部分酒精渗透。皮肤角质细胞间的脂质结构会限制酒精穿透，仅有微量可能进入真皮层。日常使用医用酒精消毒时，短暂接触不会导致体内酒精浓度显著升高。实验数据显示，完整皮肤对75％医用酒精的吸收率通常不足1％，且主要停留在角质层。
当皮肤存在破损、溃疡或大面积创伤时，酒精渗透率会明显增加。烧伤患者使用酒精消毒可能导致血液中检出乙醇，长期大面积皮肤接触工业酒精也可能出现轻微吸收。特殊情况下如使用含酒精的透皮制剂，会通过促渗技术提高吸收率，这与普通消毒酒精的渗透机制不同。
使用酒精消毒时应避开眼睛及黏膜部位，皮肤破损区域建议改用碘伏等刺激性小的消毒剂。日常接触酒精后出现皮肤干燥脱屑，可涂抹含神经酰胺的保湿霜修复皮肤屏障。若需长期频繁接触酒精，应佩戴防护手套并加强手部护理。
