1.主要与梅克尔憩室相鉴别，与梅克尔憩室的区别在于畸形发生的部位，位于肠系膜远着为重复畸形，而梅克尔憩室则在憩室对侧缘。梅克尔憩室多数位于回肠末段对系膜缘距离回盲部150cm以内，有独立血供。仅4％-6％的憩室可出现症状。其室内常常存在迷生组织，常见有胃粘膜、胰腺组织等，可能导致憩室穿孔、出血，大量出血将导致患儿出现贫血、休克，需输血。部分憩室顶端与脐部有索带连接，可导致内疝发生。此外憩室的存在可导致肠管扭转、套叠、压迫、黏连引起梗阻。合并憩室炎则表现为发热、右下腹痛，与阑尾炎难以鉴别，手术中应注意探查。2.肠系膜囊肿的囊壁由上皮细胞构成，囊肿呈半透明状，囊内有淡黄色淋巴液，囊壁无肌层组织，它与伴行的肠管无共同血管，容易分离。肠重复畸形有完整的肠壁，与正常肠壁紧紧贴附，并有正常血管，不容易分离。
