小儿肺炎大多数情况下没有后遗症，极少数严重的肺炎可能会出现后遗症。能够造成小儿肺炎有后遗症的，主要是大叶性肺炎、脓胸、肺结核等这类炎症，是肺炎中比较严重的类型。常见的后遗症就是肺不张或者是胸膜肥厚增生、肺纤维化等。出现小儿肺炎的后遗症的这些情况，多数是因为病情严重、治疗不及时或者完全没有治疗的前提下，才容易出现这些并发症。而大多数肺炎都是单纯感染肺部的局部组织，通过及时地治疗都会完全地康复好转，不留后遗症。一旦出现后遗症，一般是不可逆的。后期只能通过加强体育锻炼，增加肺活量的方式，代偿性地增加肺功能，一般对生命没有影响。
