移植病人病毒性肺炎的治疗效果与病毒类型、免疫抑制程度及干预时机有关，主要影响因素有病毒种类、免疫状态、合并感染、基础疾病控制情况。
巨细胞病毒或呼吸道合胞病毒等机会性感染需针对性抗病毒治疗，如更昔洛韦静脉制剂、膦甲酸钠注射剂、西多福韦注射液，伴随发热和血氧下降时需氧疗支持。
移植后强效免疫抑制剂使用会延缓病毒清除，需在监测血药浓度下调整他克莫司或环孢素剂量，同时可能出现淋巴细胞计数持续偏低。
混合细菌或真菌感染需联用哌拉西林他唑巴坦、伏立康唑等广谱药物，常见多重耐药菌感染导致治疗周期延长。
移植物抗宿主病活动期会加重肺损伤，需增加甲泼尼龙冲击治疗，表现为进行性呼吸困难伴影像学磨玻璃影扩大。
移植患者出现持续发热或呼吸频率加快时应立即就医，住院期间需严格隔离防护并监测心肺功能，恢复期补充优质蛋白和维生素D有助于免疫功能重建。
