霉菌性阴道炎和滴虫性阴道炎的治疗难度与复发风险不同，滴虫性阴道炎通常更难根治。主要影响因素有病原体特性、药物敏感性、治疗依从性、合并感染。
滴虫为原虫，具有较强活动性和隐匿性，可能潜伏于尿道或腺体；霉菌为真菌，局部繁殖为主，甲硝唑对滴虫的杀灭效果可能受生物膜影响。
霉菌感染常用氟康唑等唑类药物，耐药率较低；滴虫对甲硝唑耐药株逐渐增多，部分病例需联用替硝唑或局部用药。
滴虫治疗需伴侣同步用药且禁酒，依从性差易复发；霉菌治疗期间仅需避免局部刺激，单剂量用药方案完成度更高。
滴虫常合并细菌性阴道病，混合感染延长疗程；霉菌重复感染多与糖尿病或抗生素使用相关，基础病控制后复发率下降。
治疗期间建议避免性生活，穿棉质内裤并每日更换，完成规定疗程后需复查确认病原体清除，糖尿病患者需同步控制血糖。
