吃番茄通常有助于消化。番茄含有丰富的膳食纤维、有机酸及多种活性成分，能够促进胃肠蠕动、刺激胃酸分泌，对改善功能性消化不良有一定帮助。
番茄中的膳食纤维可增加粪便体积并软化质地，减少肠道传输时间，尤其对因膳食纤维摄入不足导致的便秘效果明显。其果胶成分能调节肠道菌群平衡，而柠檬酸和苹果酸可增强胃蛋白酶活性。对于胃酸分泌不足或餐后饱胀感明显的人群，适量食用熟制番茄能缓解症状。需注意未成熟番茄含较多单宁酸，可能加重胃黏膜刺激。
存在胃食管反流或消化性溃疡急性期时，番茄可能诱发反酸或疼痛。番茄红素等脂溶性成分需配合油脂烹饪才易吸收，生吃效果有限。部分肠易激综合征患者对番茄中的FODMAP成分敏感，可能引发腹胀等不适。特殊情况下如胃大部切除术后，高酸度番茄可能影响残胃功能。
建议将番茄作为均衡饮食的一部分，避免空腹大量食用。慢性胃肠疾病患者需观察个体耐受性，优先选择去皮去籽的烹饪方式。若出现持续腹痛、腹泻等异常反应，应及时排查番茄过敏或相关器质性疾病。
