豆芽在正常情况下不会引起食物中毒，但若储存不当或加工不彻底可能引发食品安全问题。豆芽富含维生素C、膳食纤维等营养素，是常见的健康食材。
新鲜豆芽在适宜环境下生长并充分清洗后，致病菌污染概率较低。豆芽中毒多与沙门氏菌、大肠杆菌等微生物污染有关，这些细菌可能通过水源、土壤或储存容器附着在豆芽表面。购买时应选择芽体饱满、无褐变、无异味的豆芽，冷藏保存不宜超过两天。凉拌豆芽需用沸水焯烫，炒制需确保中心温度达到70摄氏度以上。
部分特殊情况下食用豆芽存在较高风险。发芽时间过长的豆芽可能产生有害生物碱，豆粒发黑或黏液分泌过多表明已变质。集体食堂或餐饮单位若批量处理豆芽时未规范操作，易引发群体性食源性疾病。免疫力低下人群、孕妇及儿童应避免生食豆芽，出现腹痛腹泻等中毒症状需及时补液并就医。
日常处理豆芽时可先用淡盐水浸泡十分钟，流水冲洗三遍以上去除杂质。建议将豆芽彻底加热后食用，避免与生肉共用砧板。若进食豆芽后出现恶心呕吐、发热等症状，应保留剩余食物样本供检测，轻度脱水可口服补液盐，严重者需进行抗感染治疗。
