适量食用西红柿一般不会加重胃酸，但过量食用可能刺激胃酸分泌。西红柿含有柠檬酸和苹果酸等有机酸，可能对胃黏膜产生轻微刺激。胃酸分泌过多或存在胃食管反流病、胃炎等疾病时，需控制摄入量。
西红柿的有机酸含量在常见蔬菜水果中属于中等水平，正常人群每日摄入200-300克通常不会引起明显不适。其含有的果胶和膳食纤维有助于调节胃肠蠕动，维生素C和番茄红素具有抗氧化作用。烹饪后有机酸部分分解，对胃部刺激减小，如制成番茄汤或与鸡蛋同食可降低酸性影响。胃酸分泌正常者空腹吃少量新鲜西红柿较少引发反酸，但建议避免与高糖食物同食，以免加速胃排空。
存在慢性胃炎或胃溃疡时，西红柿可能加重烧心感，尤其在空腹状态下摄入酸性物质会直接接触受损胃黏膜。胃食管反流患者进食后可能出现胸骨后灼痛，因酸性成分松弛食管下括约肌。部分人群对茄科植物敏感，摄入后诱发胃肠功能紊乱。胃部手术后的患者消化能力下降，需将西红柿去皮去籽后少量食用。夜间胃酸分泌增多阶段应避免食用，可选择低酸品种如樱桃番茄。
胃酸过多者可选择成熟度高的西红柿，其酸度低于未完全成熟的果实。搭配碱性食物如燕麦、馒头等能中和部分酸性。出现持续反酸或疼痛应排查幽门螺杆菌感染，必要时使用铝碳酸镁咀嚼片、雷贝拉唑钠肠溶片等药物。日常需规律进食，避免暴饮暴食，餐后2小时内不宜平卧。胃部敏感者记录饮食日记有助于识别个体化禁忌食物。
