危害一：导致不孕，影响生育：一旦卵巢囊肿变大或者变性，就有可能使精子、卵子或者受精卵不能正常运行，从而影响生育，导致不孕的恶果。 危害二：引发流产、难产：卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠时囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。 危害三：导致女性容颜早衰：卵巢囊肿会引发早衰、内分泌失调、恶变，甚至会引发卵巢癌。 危害四：发生癌变，威胁生命：卵巢囊肿增大极易发生扭曲、感染、出血或爆裂，给患者带来生命的威胁。有些肿瘤性的囊肿甚至会发生癌变。 危害五：导致水肿，影响生活：卵巢囊肿患者除了能感觉到食欲不良、体重减轻和腹部肿胀之外，还可能引起呕吐、发烧和腹部剧痛；后期甚至会导致腹部与四肢发生水肿。
