扁桃体结石通常无须药物治疗，可通过日常护理改善，若症状严重可遵医嘱使用复方氯己定含漱液、西吡氯铵含片、阿莫西林克拉维酸钾片等药物。
扁桃体结石是扁桃体隐窝内脱落上皮、食物残渣等物质钙化形成的硬块，多数情况下通过加强口腔清洁可自行排出。每日用温盐水漱口有助于清除隐窝内碎屑，使用冲牙器轻柔冲洗扁桃体区域也能帮助排出小结石。若合并明显口臭或咽部异物感，复方氯己定含漱液可抑制细菌繁殖，西吡氯铵含片能缓解局部炎症。当继发急性感染时，医生可能开具阿莫西林克拉维酸钾片等抗生素控制感染，但需注意长期使用抗生素可能破坏口腔菌群平衡。
日常应保持规律作息，避免辛辣刺激食物，戒烟限酒以减少扁桃体隐窝分泌物堆积。
