漱口水正确使用方法是含漱30秒后吐出，无须再用清水漱口，每日使用次数不宜超过3次。
漱口水使用前应先用清水漱口清除食物残渣，取10-20毫升倒入量杯或瓶盖中，避免直接对嘴倾倒。将液体含在口腔内，紧闭嘴唇鼓动颊部使液体充分接触牙龈、舌侧等部位，保持30秒后全部吐出。含漱时头部可稍后仰帮助液体到达咽喉部，但需注意防止误吸。治疗性漱口水建议在刷牙后使用，保健型可在餐后使用。含酒精成分的漱口水可能引起短暂刺激感，儿童、孕妇及口腔溃疡患者应选择无酒精配方。使用后30分钟内避免进食饮水以维持有效成分作用。长期使用同一品牌可能影响口腔菌群平衡，可间隔更换不同类型。
日常使用漱口水时需配合巴氏刷牙法及牙线清洁，定期进行口腔检查。
