食用菌类富含多种营养素，主要有蛋白质、膳食纤维、维生素B族、矿物质和活性多糖等成分。
食用菌类含有丰富的植物蛋白，其氨基酸组成接近人体需求，部分菌类的蛋白质含量甚至超过普通蔬菜。香菇、平菇等菌类中的蛋白质易于消化吸收，可作为素食者优质蛋白的补充来源。菌类成分中的真菌蛋白还可能具有调节免疫功能的潜力。
菌类含有大量可溶性和不可溶性膳食纤维，尤其是β-葡聚糖等特殊多糖成分。这些膳食纤维能够促进胃肠蠕动，帮助维持肠道菌群平衡。金针菇、杏鲍菇等菌柄类品种的纤维含量尤为突出，适量食用有助于改善消化功能。
食用菌是维生素B1、B2、烟酸等B族维生素的良好来源。其中香菇富含维生素B12，这对素食者尤为重要。维生素B族参与能量代谢和神经系统功能，双孢蘑菇等品种经过日晒后还能生成维生素D前体，经过人体转化后有助于钙质吸收。
菌类富含钾、磷、镁、锌、硒等多种矿物质。特别是硒元素含量较高，如牛肝菌的硒含量远超普通食材。这些矿物质参与人体多种酶系统活动，硒元素还具有抗氧化作用。不同品种的矿物质组成存在差异，多样化食用可获得更全面的营养。
香菇多糖、灵芝多糖等菌类特有成分具有免疫调节功能。这些活性多糖能够刺激免疫细胞活性，部分研究显示其可能辅助提升机体抵抗力。虽然日常食用量难以达到药理剂量，但长期适量摄入可能对健康产生积极影响。
食用菌类时需注意选择新鲜无霉变的品种，充分加热煮熟后食用。对菌类过敏者应避免食用，肾功能不全者需控制摄入量。建议将菌类纳入日常膳食结构，每周食用2-3次，与蔬菜、谷物等食材搭配，可最大化其营养价值。不同菌类可交替食用以获得更全面的营养补充。
