抗生素副作用通常在用药后1-2天内出现，实际时间受到药物种类、个体差异、用药剂量、合并疾病等多种因素的影响。
1、药物种类青霉素类抗生素如阿莫西林可能在使用后数小时出现过敏反应，头孢类抗生素如头孢呋辛可能在24小时内引发胃肠不适，大环内酯类抗生素如阿奇霉素可能在使用后1-3天出现肝功能异常。
2、个体差异儿童和老年人代谢较慢可能导致副作用延迟出现，肝肾功能异常者药物清除率下降会延长副作用显现时间，遗传因素如药物代谢酶基因变异可能影响副作用发生时间。
3、用药剂量大剂量静脉给药时副作用可能在使用后立即显现，长期口服抗生素如多西环素可能在用药3天后逐渐出现菌群失调症状，超说明书剂量使用可能加速副作用发生。
4、合并疾病脱水患者使用氨基糖苷类抗生素如庆大霉素可能更快出现肾毒性，免疫缺陷患者使用广谱抗生素可能较早发生二重感染，慢性肝病患者使用抗结核药可能提前出现药物性肝损伤。
用药期间建议记录不适症状出现时间，避免与酒精或特定食物同服，出现严重过敏或持续性腹泻应及时就医调整用药方案。
