复方甲氧那明胶囊的副作用主要有胃肠道不适、头晕嗜睡、心悸胸闷、过敏反应等。
复方甲氧那明胶囊可能引起恶心呕吐、腹痛腹泻等消化道症状，与药物刺激胃肠黏膜有关。出现症状时可遵医嘱调整为餐后服药，必要时使用奥美拉唑肠溶胶囊、蒙脱石散、双歧杆菌三联活菌胶囊等药物缓解。
药物中的镇咳成分可能抑制中枢神经系统，导致乏力头晕、注意力下降等症状。用药期间应避免驾驶或高空作业，严重者可遵医嘱更换为右美沙芬、福尔可定等中枢性镇咳药。
甲氧那明作为拟交感神经药物可能引起心动过速、血压波动等反应，原有心血管疾病患者需谨慎使用。出现症状时应监测心率血压，必要时联用美托洛尔缓释片、硝酸甘油片等心血管药物。
少数患者可能对药物成分过敏，表现为皮疹瘙痒、喉头水肿等超敏反应。需立即停药并就医，可遵医嘱使用氯雷他定片、地塞米松注射液、肾上腺素注射液进行抗过敏治疗。
用药期间避免饮酒或含咖啡因饮品，出现严重副作用应及时就医调整用药方案，过敏体质者用药前需告知医生既往过敏史。
