艾草对金黄色葡萄球菌、大肠杆菌、白色念珠菌、绿脓杆菌等常见致病菌具有抑制作用，其挥发油成分是抗菌活性的主要来源。
艾草精油中的桉叶素和樟脑可破坏细菌细胞膜，临床研究显示对耐甲氧西林金黄色葡萄球菌也有抑制效果，可配合医生使用含艾草成分的抗菌制剂。
艾草水煎剂通过抑制细菌DNA旋转酶干扰其复制，对产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌仍有效，出现腹泻症状时可考虑中西医结合治疗。
艾草中的黄酮类物质能破坏真菌细胞壁几丁质结构，对阴道念珠菌病辅助治疗有效，需在医生指导下联用抗真菌药物。
艾草醇提物可抑制绿脓杆菌生物膜形成，对烧伤创面感染有潜在应用价值，严重感染时仍需规范使用抗生素。
使用艾草制品前应进行过敏测试，孕妇及过敏体质者慎用，出现感染症状应及时就医明确病原体类型。
