包皮上有小疙瘩可能由珍珠状阴茎丘疹、皮脂腺异位症、尖锐湿疣、包皮龟头炎等原因引起，可通过局部清洁、药物治疗、物理治疗、手术切除等方式处理。
1、珍珠状阴茎丘疹：可能与局部卫生不良或生理发育异常有关，表现为白色或淡红色小丘疹，无须特殊治疗，保持清洁即可。
2、皮脂腺异位症：通常与激素水平变化有关，表现为黄色小颗粒，一般无须处理，必要时可遵医嘱使用维A酸乳膏、氢化可的松软膏等药物。
3、尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染导致，表现为菜花状赘生物，需遵医嘱使用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物，或采用冷冻、激光治疗。
4、包皮龟头炎：可能与细菌或真菌感染有关，伴随红肿、瘙痒，可遵医嘱使用克霉唑乳膏、莫匹罗星软膏等药物，反复发作需考虑包皮环切术。
日常注意会阴部清洁，避免抓挠，出现持续增大、溃烂或伴随分泌物时应及时就诊皮肤科或泌尿外科。
