病毒性脑炎抗病毒治疗一般需要14-21天，实际疗程受到病毒类型、病情严重程度、免疫状态、治疗反应等多种因素的影响。
1、病毒类型单纯疱疹病毒脑炎需连续静脉滴注阿昔洛韦21天，肠道病毒脑炎可能缩短至14天。不同病毒对药物敏感性差异显著。
2、病情程度轻度脑炎伴意识清楚者疗程可适当缩短，重症脑炎合并脑水肿或癫痫持续状态者需延长至3周以上。
3、免疫状态免疫功能正常患者标准疗程为2-3周，HIV感染者或移植术后患者可能需要更长时间维持治疗。
4、治疗反应用药3天后评估体温、脑脊液指标改善情况，若效果不佳需考虑耐药可能并调整方案。
治疗期间需监测肝肾功能，出现定向力障碍或新发癫痫发作应立即复查脑脊液。恢复期建议逐步进行认知功能康复训练。
