病毒性胃肠炎通常无须使用抗病毒药物，以对症治疗为主。若出现严重症状或免疫缺陷者，可遵医嘱使用利巴韦林、更昔洛韦、奥司他韦等抗病毒药物，同时需补充电解质防止脱水。
1、利巴韦林广谱抗病毒药物，适用于轮状病毒等引起的重症胃肠炎，可能引起溶血性贫血等不良反应，儿童使用需严格监测血常规。
2、更昔洛韦针对巨细胞病毒性胃肠炎，常见副作用包括骨髓抑制，用药期间需定期检查肾功能与血细胞计数。
3、奥司他韦对流感病毒合并胃肠症状有效，可能出现头痛恶心等反应，肾功能不全者需调整剂量。
4、硝唑尼特用于儿童轮状病毒性肠炎，可缩短病程，常见不良反应为轻度胃肠道不适。
病毒性胃肠炎患者应少量多次饮用补液盐溶液，避免高糖高脂饮食，婴幼儿需及时就医评估脱水程度。
