单纯疱疹病毒与生殖器疱疹的主要区别在于感染部位、病毒分型及临床表现。单纯疱疹病毒分为1型和2型，1型多引起口唇疱疹，2型主要导致生殖器疱疹；生殖器疱疹特指由2型病毒引发的生殖器部位感染。
1、病毒分型差异：
单纯疱疹病毒1型主要通过口腔分泌物传播，常引起口周、面部水疱；2型病毒主要通过性接触传播，90％生殖器疱疹由其引起。两种病毒存在交叉感染可能，但2型病毒更易在骶神经节潜伏。
2、临床表现不同：
口唇疱疹表现为唇缘簇集性小水疱，伴灼热感；生殖器疱疹则在阴茎、阴唇等部位出现溃疡性皮损，常伴腹股沟淋巴结肿大。生殖器疱疹首次发作症状更剧烈，复发率高达80％。
3、传播途径区别：
1型病毒可通过共用餐具、亲吻传播；2型病毒主要经性行为传播。新生儿经产道感染2型病毒可能引发致命性脑炎，1型病毒母婴传播风险较低。
4、并发症差异：
生殖器疱疹可能引起无菌性脑膜炎、直肠炎等并发症，孕妇感染可能导致流产；口唇疱疹较少引发严重并发症，免疫缺陷者可能发生疱疹性角膜炎。
5、治疗原则相似：
两者均需抗病毒治疗，常用药物包括阿昔洛韦、伐昔洛韦和泛昔洛韦。生殖器疱疹需加强性伴侣筛查，口唇疱疹发作期应避免接触婴幼儿。
预防方面需针对性采取防护措施：口唇疱疹患者发作期应避免共享餐具，生殖器疱疹感染者需使用避孕套并告知性伴侣。日常可补充赖氨酸、维生素C增强免疫力，复发频繁者建议进行病毒抗体检测。保持规律作息、缓解压力有助于减少复发，皮损部位需保持清洁干燥避免继发感染。
