还有部分患者由于急性期后炎症持续，转为慢性心肌炎逐渐出现进行性心脏扩大、心功能减退、心律失常经过数年或一、二十年后死于上述各并发症。各阶段的时间划分比较难定一般可以6个月以内为急性期，6月至1年为恢复期，1年以上为慢性期急性期不明确的慢性患者与心肌病难区分，据当前认识与已有证据，有一部分心肌病是由心肌炎演变而来。
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小儿病毒性心肌炎可通过中药汤剂、针灸疗法、推拿按摩等中医治疗方式干预。
中医认为该病多因外感邪毒内侵心脉所致，治疗以益气养阴、活血通络为主。常用方剂包括生脉饮、炙甘草汤、参附注射液等，生脉饮由人参、麦冬、五味子组成，可改善心肌供血；炙甘草汤含炙甘草、生姜、大枣，能调节心律；参附注射液具有抗病毒和心肌保护作用。针灸常选取内关、膻中、心俞等穴位，通过刺激经络调节心脏功能。小儿推拿可采用清心经、揉内关等手法，配合捏脊疗法增强体质。部分患儿需结合耳穴压豆治疗，选取心、交感等耳部反射区。
治疗期间需避免剧烈运动，保持充足睡眠，饮食宜清淡并适量食用莲子、百合等养心食材。
