脑血栓后遗症的恢复程度因人而异，主要与梗死部位、治疗时机及康复干预有关。
脑血栓后遗症可能表现为肢体偏瘫、言语障碍或认知功能下降。若梗死范围小且未累及关键功能区，早期溶栓治疗配合康复训练可使功能显著改善。部分患者通过3-6个月的规范康复，肌力可恢复至4级以上，语言清晰度明显提高。对于基底节区小灶性梗死，约半数患者6个月内能恢复基本生活自理能力。但若主干动脉闭塞导致大面积脑梗死，即使经过系统康复，仍可能遗留永久性功能障碍，如偏侧肢体挛缩或完全性失语。脑干梗死患者常存在吞咽困难等延髓麻痹症状，需长期鼻饲营养支持。
恢复期应坚持在康复医师指导下进行运动疗法和作业训练，同时控制血压血糖等基础疾病。
