双眼皮埋线手术过程中通常会有轻微疼痛感，但多数人可以耐受。手术前会进行局部麻醉，能有效减轻操作时的疼痛感。
双眼皮埋线手术采用局部浸润麻醉，在眼睑皮下注射利多卡因等麻醉药物后，求美者仅能感受到轻微针刺感。麻醉起效后，手术操作区域痛觉会明显减弱，仅可能感受到牵拉或压迫等不适。手术时间较短，通常在30-60分钟内完成，术后麻醉效果消退后可能出现轻微胀痛，程度类似于眼皮被轻微夹伤的感觉，一般持续1-3天会逐渐缓解。术中疼痛感受与个人痛阈相关，对疼痛敏感者可能体验到更明显的不适感。
极少数情况下可能出现麻醉效果不理想的情况，此时操作过程中可能感受到短暂锐痛。部分求美者在缝合线体穿过眼睑组织时会有瞬间的牵拉痛感，但这种疼痛持续时间极短。术后恢复期若出现持续加重的剧烈疼痛，可能提示感染或线体排斥等并发症，需要及时就医处理。瘢痕体质者术后疼痛持续时间可能延长，并伴随更明显的肿胀反应。
术后可通过冰敷减轻肿胀疼痛，避免揉眼或过度用眼。保持伤口清洁干燥，遵医嘱使用抗生素眼膏预防感染。饮食宜清淡，避免辛辣刺激食物。若疼痛持续超过一周或伴随发热、分泌物增多等症状，应及时复诊检查。术后恢复期间注意作息规律，保证充足睡眠有助于减轻不适感。