扁桃体周围脓肿一般不会遗留后遗症，但若治疗不及时或护理不当，可能引发局部或全身并发症。扁桃体周围脓肿多由细菌感染导致，需通过抗生素治疗或脓肿切开术干预。
多数患者经规范治疗后预后良好，脓肿消退后无长期影响。急性期及时使用阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克肟分散片等抗生素可有效抑制感染，配合脓肿引流术能快速缓解咽痛、吞咽困难等症状。术后注意口腔清洁，避免辛辣刺激饮食，通常1-2周可完全恢复。
少数情况下可能出现并发症，如脓肿扩散导致咽旁间隙感染、败血症等全身反应，或反复发作引发慢性扁桃体炎。糖尿病患者、免疫力低下者风险较高。若术后持续发热、颈部肿胀或呼吸困难，需警惕深部感染，应立即复查。反复发作患者可考虑后期行扁桃体切除术以预防复发。
恢复期需保持清淡饮食，每日用生理盐水漱口3-4次，避免剧烈咳嗽或用力清理咽喉。观察体温变化，若术后3天仍有38℃以上发热或局部红肿加重，应及时复诊。日常加强锻炼、保证睡眠有助于提升免疫力，减少呼吸道感染概率。