颅内静脉系统血栓形成与脑动脉血栓形成在发病机制、临床表现和治疗方式上存在明显区别。颅内静脉系统血栓形成是静脉回流受阻导致的疾病，脑动脉血栓形成则是动脉供血中断引发的病变。
颅内静脉系统血栓形成通常由感染、脱水、血液高凝状态等因素引起，表现为头痛、视乳头水肿、癫痫发作等症状。脑动脉血栓形成多与动脉粥样硬化、房颤等疾病相关，常见症状包括偏瘫、失语、意识障碍等。影像学检查是鉴别两者的重要手段，CT静脉造影对颅内静脉系统血栓形成诊断价值较高，而CT血管造影或磁共振血管成像更适合诊断脑动脉血栓形成。
治疗方面，颅内静脉系统血栓形成以抗凝治疗为主，常用药物包括低分子肝素钙注射液、华法林钠片等。脑动脉血栓形成在急性期可考虑静脉溶栓治疗，如注射用阿替普酶，后续需长期抗血小板治疗，如阿司匹林肠溶片、硫酸氢氯吡格雷片等。两种疾病的预后差异较大，颅内静脉系统血栓形成经过及时治疗预后相对较好，脑动脉血栓形成往往遗留不同程度的神经功能缺损。
预防颅内静脉系统血栓形成应注意保持充足水分摄入，避免长期卧床，存在高凝状态者需定期监测。预防脑动脉血栓形成需控制高血压、糖尿病等基础疾病，戒烟限酒，规律服用抗血小板药物。出现可疑症状时应立即就医，完善相关检查明确诊断，在医生指导下进行规范化治疗。