疱疹性咽峡炎通常可以自愈，但需根据病情严重程度决定是否干预。治疗方式主要有对症处理、抗病毒治疗、预防并发症三种。
1、对症处理
疱疹性咽峡炎患者出现发热时可使用布洛芬混悬液或对乙酰氨基酚口服溶液退热，咽痛明显者可选用复方氯己定含漱液缓解症状。保持口腔清洁有助于减轻不适，可用温盐水漱口。饮食宜选择流质或半流质食物，避免辛辣刺激性食物加重黏膜损伤。
2、抗病毒治疗
对于免疫功能低下或症状严重的患者，可遵医嘱使用阿昔洛韦颗粒或更昔洛韦分散片进行抗病毒治疗。此类药物能抑制病毒复制，缩短病程。使用期间需监测肝肾功能，儿童患者家长需注意观察有无皮疹等不良反应。
3、预防并发症
疱疹性咽峡炎可能并发脱水或细菌感染，家长需保证患儿充足饮水量，出现持续高热、精神萎靡等症状时及时就医。继发细菌感染时可使用阿莫西林克拉维酸钾干混悬剂或头孢克洛颗粒，但须在医生指导下使用。
疱疹性咽峡炎患者应保持充足休息，居家隔离至症状完全消退。饮食以易消化、营养均衡为主，适当补充维生素C和B族维生素。注意观察病情变化，若出现吞咽困难、尿量减少等表现需立即就医。日常加强手卫生，避免与婴幼儿密切接触，可有效预防疾病传播。