病毒和细菌的根本区别在于病毒是非细胞结构、必须依赖宿主细胞复制，而细菌是独立生存的单细胞生物。病毒主要由核酸和蛋白质外壳构成，细菌则具备完整细胞结构（细胞壁、细胞膜、细胞质等）。
1、结构差异
病毒仅由遗传物质（DNA或RNA）和蛋白质衣壳组成，部分病毒有脂质包膜。细菌具有完整的细胞结构，包括细胞壁、细胞膜、核糖体等，其遗传物质游离于细胞质中。病毒缺乏代谢酶和能量合成系统，必须侵入宿主细胞才能增殖。
2、增殖方式
病毒通过吸附、注入、复制、组装、释放五个步骤在宿主细胞内复制，利用宿主资源完成生命周期。细菌通过二分裂方式进行独立繁殖，在适宜环境下可自主完成DNA复制和细胞分裂，繁殖速度远快于病毒。
3、大小差异
病毒直径通常在20-400纳米之间，需电子显微镜观察。细菌直径多为0.5-5微米，可用普通光学显微镜观察。病毒体积约为细菌的千分之一，是目前已知最小的生命形式。
4、对抗生素反应
细菌对抗生素敏感，因抗生素可破坏其细胞壁或干扰代谢过程。病毒对抗生素无反应，需使用特异性抗病毒药物（如奥司他韦胶囊、阿昔洛韦片、更昔洛韦注射液）干扰其复制周期。滥用抗生素治疗病毒感染会导致耐药性。
5、致病机制
细菌通过释放毒素或直接侵袭组织致病，如链球菌性咽炎、结核病。病毒通过劫持宿主细胞导致细胞病变，如流感病毒破坏呼吸道上皮细胞。部分病毒（HPV16型）可整合宿主DNA诱发癌症，细菌致癌机制多与慢性炎症相关。
日常预防需针对性采取不同措施：细菌感染可通过洗手、消毒物品表面减少接触传播；病毒感染需注重呼吸道防护（戴口罩）、接种疫苗。出现持续发热、化脓性分泌物等细菌感染症状，或出现皮疹、全身酸痛等病毒感染症状时，应及时就医进行病原学检测，避免自行使用抗生素或抗病毒药物。